Tsuguri Tatsuno und seine Freunde, sind große Digimon Fans und besitzen deswegen alle ein Digimon Mini.
Eines Tages erfährt Tsuguri von seinem Freund, dass es nun möglich sei, auch online über das Battle Terminal seine Fähigkeiten als Tamer unter Beweis stellen zu können, doch ihm wird gesagt, dass sein Greymon illegal sei. Die Grenze zwischen der Digiwelt und der realen Welt verwischt immer mehr und aus dem Spiel wird langsam ernst. Welche böse Macht steckt hinter diesen Vorkommnissen und kann die Sache noch aufgehalten werden?